上部　禅宗
第一编　禅宗法要／003
　　禅源／003
　　调习／005
　　入圣／011
　　坐禅仪／013
第二编　真心直说／015
　　古德禅师真心直说序／015
　　重刊真心直说序／015
　　真心直说／016
　　后跋／028
　　附答顺宗心要法门／029
第三编　宗门语要／035
　　引言／035
　　七佛偈／035
　　六祖慧能大师／036
　　南岳怀让禅师／038
　　南岳第一世／039
　　南岳第二世／040
　　南岳第三世／046
　　南岳第四世／051
　　南岳第五世／065
　　南岳第六世／065
　　南岳第七世／066
　　南岳第八世／067
　　曹溪别出第二世／067
　　曹溪别出第五世／067
　　青原山行思禅师／068
　　青原第一世／068
　　青原第二世／070
　　青原第三世／072
　　青原第四世／073
　　青原第五世／076
　　青原第六世／082
　　青原第七世／093
　　青原第八世／095
　　青原第九世／098
　　青原第十世／102
　　旁出诸祖／103
　　禅门达者／109
　　诸方广语摘录／110
　　赞颂诗歌／120
　　补遗／139
第四编　证道歌注释／160
　　卷首语／160
　　竺源禅师注证道歌序／161
　　证道歌注释／161

下部　密宗
第五编　医宗了义／193
　　贪道口诀／193
　　解脱赫日／251
第六编　医宗经脉／344
　　引言／344
　　附明行道六成就序／345
　　显明大密妙义深道六法引导广论／346
　　祝拔宗契合俱生大手印论双融／431
　　依吉祥上乐轮方便智慧双运道玄义卷／431
　　陈健民大德论双运／450
　　尾跋／452
第七编　医宗梯航／458
　　前言／458
　　仪轨精华／458
　　赞颂诗歌／502
　　附录／537

后　序／542